承担港航系统预决算编报和预算下达工作。承担中心本级和指导下属单位的财务工作。承担港航系统内部审计和绩效评价工作。牵头做好港航系统国有资产的登记、出让、租赁、报废等管理工作。协助管理港口经营性收费。